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- Liste plantes aquatiques protégées
- Lithosie aplatie
- Lithosie grise
- Lithosie plombée
- Lithosie quadrille
- Littorelle uniflore
- Livrée
- Lièvre brun
- Lobélie brûlante
- Lobélie de Dortmann
- Loche d'étang
- Loche de rivière
- Loche franche
- Locustelle luscinioïde
- Locustelle tachetée
- Loir gris
- Loriot d'Europe
- Lotier corniculé
- Lotier hérissé
- Lotier pied de poule
- Lotier très étroit
- Lotte de rivière
- Loup
- Loutre commune
- Louvette
- Lucane cerf-volant
- Lucine
- Luciole
- Ludwigia des marais
- Lunaire
- Lunetière
- Lupin arborescent
- Lusciniole à moustaches
- Luzerne hérissée
- Luzule champêtre
- Lychnide des Alpes
- Lychnis fleur de coucou
- Lycogale des arbres
- Lycoperdon
- Lynx boréal
- Lysimaque des bois
- Lythrum à feuilles d'hysope
- Lépidoptères
- Lépiote de Josserand
- Lépiote déguenillée
- Lépiote jaune
- Lépiote presque lisse
- Lépiote pudique
- Lépiote à crète
- Lépiote élevée
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